안녕하세요.
파이썬 공부를 제대로 하고 계시네요. 멋집니다.

지금과 같은 방식으로 프로그래밍하면 머리가 복잡하고 골치아픔을 피할 수 없습니다.

하지만 지뢰찾기와 같은 프로그램은 좀 더 쉬운 방법이 있습니다.

지뢰찾기 게임과 같은 프로그램을 짜기 위해서는 파이썬 패키지 중 
numpy와 scipy와 같은 것을 이용해야 합니다.

numpy는 배열와 행렬을 쉽게 처리할 수 있는 자료 구조를 제공하고, scipy는 과학 계산용 모듈을 제공합니다.

scipy.org 사이트와 구글에서 numpy와 scipy로 검색하여 관련된 자료를 찾아서 공부해 보세요.

그리고 다음의 내용을 참고해 주세요.

1) 지뢰가 있는 위치가 저장되는 2차원 배열
예 :
     0 1 1 0 0
     0 0 1 1 0
     1 0 0 0 1

이런식으로 배열로 저장하면 1은 지뢰가 있고, 0은 지뢰가 없는 곳입니다.
이렇게 저장해 놓으면 지뢰에 개수를 셀 때 주변 배열 원소를 더하면 됩니다.

2. 메모리에 저장되는 것과 화면에 표시되는 것을 달리한다.
화면에 표시할 2차원 배열에는 원래 생각하신대로 .이나 *등을 이용하면 됩니다.

3. 지뢰 개수 카운트
   지뢰 개수를 구하기 위해 if문을 이용하여 누적하는 게 아니라 수학이나 컴퓨터 공학에서 얘기하는 마스크(mask)라는 것이 있습니다.
지뢰찾기에서 마스크는 3x3 마스크가 됩니다. 
이 마스크가 좌에서 우로 할 줄씩 이동하면서 지뢰의 개수를 센 다음 새로운 배열에 저장하는 식으로 하여야 합니다.

대략 제가 설명하고자하는 것을 이해하실 수 있으시지요?

서울에서 부산에 있는 어떤 집을 찾아가는 데 꼭 걸어가거나 자전거를 타고 갈 필요는 없습니다.
KTX나 기차가 어디에서 출발하는 지 출발시간을 알아보고 부산에서 내려서는 버스를 타고 내려서 목적지에 걸어가는 방식을 취해야 겠지요.

프로그래밍을 하는 것도 마찬가지입니다. 

스타트 파이썬으로 기본기는 익히신 것 같으니
지금 단계에서는 mumpy나 scipy와 같은 패키지와 자료 구조 등을 공부하는 것이 좋을 듯 합니다.

numpy와 scipy는 기차와 KTX와 같은 기능을 제공합니다.

궁금하신 점은 또 질문해 주세요.

도움이 되시길....^^